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0045【宏基因组】-通过docker常用命令及安装qiime2
Docker简介
1.什么是容器
一种操虚拟化的方案操作系统级别的虚拟化只能允运行相同或相似内核的操作系统——只能允许linux依赖于linux内核特性:Namespace和C groups(control group)
2. 容器的优点
内存占用 容器只需要占用应用的内存,而…
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2024/10/25 7:29:03
2398 Toy Storage
#和POJ上的2318一样的,就是输入确定纸板的边界点时没有按顺序,sort一下就行了
#问题 Toy Storage Time Limit: 1000MS Memory Limit: 65536KTotal Submissions: 6506 Accepted: 3886 Description Mom and dad have a problem: their child, Reza, never…
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2024/10/25 7:28:54
MS:中山大学丁涛/吴忠道-肠道菌群调控血吸虫病传播媒介光滑双脐螺适生性的新机制...
宏基因组组装的基因组揭示了血吸虫病传播媒介光滑双脐螺的碳水化合物和氮代谢机制 Metagenome-Assembled Genomes Reveal Mechanisms of Carbohydrate and Nitrogen Metabolism of Schistosomiasis-Transmitting Vector Biomphalaria Glabrata Microbiology Spectrum [IF: 7.17…
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2024/11/29 10:30:01
代谢组学简介-百趣代谢组学资讯
百趣代谢组学资讯:代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴的组学技术,是系统生物学的重要组成部分,研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。
代谢组学是对某一生物…
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2024/10/25 7:28:43
宏基因组公众号4年精华文章目录,收藏贴(2021.1更新)
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。 …
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2024/10/24 11:07:26
MEGAHIT:多快好省的宏基因组装工具
文章目录 MEGAHIT:通过简洁的de Bruijn图为超大型复杂宏基因组拼接的超快速单节点解决方案热心肠日报摘要主要结果图1. MEGAHIT工作流程表1. MEGAHIT和SPAdes在大肠杆菌数据集上的表现表2. MEGAHIT与Howe et al.和Minia组装结果比较表3. MEGAHIT与Howe et al.和Mini…
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2024/12/2 22:40:42
MS:陈宏+孙嘉+谢黎炜-肠道菌群是低碳饮食减重的决定因素
https://doi.org/10.1128/Spectrum.00223-21 在全球范围内,超重/肥胖患病率呈快速增长趋势,肥胖及其并发症不仅严重影响患者生活质量,也给社会和家庭带来沉重的经济负担。低碳水化合物饮食(low carbohydrate diets,LCD…
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2024/10/26 4:23:46
来来来,一起来pick宏基因组binning分析工具
发表期刊:Computational and Structural Biotechnology Journal(IF7.271)
发表时间:2021
研究背景
微生物是生物和环境的营养循环和代谢过程所必需的,并且与生理学至关重要。虽然微生物可以使用传统培养的方法来确定…
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2024/10/27 10:09:01