https://doi.org/10.1128/Spectrum.00223-21 在全球范围内，超重/肥胖患病率呈快速增长趋势，肥胖及其并发症不仅严重影响患者生活质量，也给社会和家庭带来沉重的经济负担。低碳水化合物饮食（low carbohydrate diets，LCD…

发表期刊：Computational and Structural Biotechnology Journal（IF7.271） 发表时间：2021 研究背景 微生物是生物和环境的营养循环和代谢过程所必需的，并且与生理学至关重要。虽然微生物可以使用传统培养的方法来确定…

今天是第1227期日报。 Nature Biotechnology综述带你开展宏基因组实验和分析，在众多分析软件中选择不再困难。还有三代测序和宏表观组等前沿技术。 基于鸟枪法宏基因组测序经历了十余年的快速发展，在分析的每个环节上出现了众多软件，让读者选…

地理相关的真菌-细菌互作贡献了高复杂度自发发酵过程中地理依赖性风味的形成 Geographically Associated Fungus-Bacterium Interactions Contribute to the Formation of Geography-Dependent Flavor during High-Complexity Spontaneous Fermentation Research Article&#…

最近想学一学宏基因组的分箱工具使用（讲真的，感觉bin还是挺复杂的，不是我这种小白该去涉猎的），本来想看看老牌工具metaWRAP的使用细节，奈何微信推送了一条新的分箱工具——SemiBin，还是基于当下…

文章目录 MEGAN-宏基因组功能和物种分类MEGAN功能简介原理简要示意图MEGAN特有文件格式：RMAMEGAN下载 MEGAN使用MEGAN（linux版本安装）MEGAN使用指南（Linux）提取注释内容（物种和功能）&#xff1a…

二三代混合组装：OPERA-MS 对于我这一批样品，分别使用了Illumina NovaSeq PE250、插入文库约400bp的双端测序，另外对于每一组平行样进行了Oxford Nanopore的单分子测序。 metaSPAdes组装短读长 由于混合组装软件OPERA-MS的运行中首先要做的…

文章目录 宏基因组二、三代测序混合组装软件OPERA-MS热心肠日报摘要主要结果图1. OPERA-MS工作流程图图2. 宏基因组数据混合组装基因组评测图3. 组装虚拟肠道微生物组图4. 移动元件和与人肠道微生物组中宿主物种的关联 总结Reference相关阅读猜你喜欢写在后面 宏基因组二、三代…