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今天是第1227期日报。 Nature Biotechnology综述带你开展宏基因组实验和分析,在众多分析软件中选择不再困难。还有三代测序和宏表观组等前沿技术。 基于鸟枪法宏基因组测序经历了十余年的快速发展,在分析的每个环节上出现了众多软件,让读者选…
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2024/11/29 10:30:05
MS | 江南大学徐岩等发现中国白酒产区地域微生态酿造优势的新证据
地理相关的真菌-细菌互作贡献了高复杂度自发发酵过程中地理依赖性风味的形成 Geographically Associated Fungus-Bacterium Interactions Contribute to the Formation of Geography-Dependent Flavor during High-Complexity Spontaneous Fermentation Research Article&#…
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2024/11/5 13:35:36
SemiBin宏基因组半监督分箱工具中GTDB数据的下载与配置
最近想学一学宏基因组的分箱工具使用(讲真的,感觉bin还是挺复杂的,不是我这种小白该去涉猎的),本来想看看老牌工具metaWRAP的使用细节,奈何微信推送了一条新的分箱工具——SemiBin,还是基于当下…
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2024/11/29 10:30:01
宏基因组注释和可视化神器MEGAN入门
文章目录 MEGAN-宏基因组功能和物种分类MEGAN功能简介原理简要示意图MEGAN特有文件格式:RMAMEGAN下载 MEGAN使用MEGAN(linux版本安装)MEGAN使用指南(Linux)提取注释内容(物种和功能):…
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2024/10/26 12:16:40
宏基因组数据二+三代混合组装并计算Read对Contig的深度
二三代混合组装:OPERA-MS
对于我这一批样品,分别使用了Illumina NovaSeq PE250、插入文库约400bp的双端测序,另外对于每一组平行样进行了Oxford Nanopore的单分子测序。
metaSPAdes组装短读长
由于混合组装软件OPERA-MS的运行中首先要做的…
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2024/11/29 3:34:27
NBT:宏基因组二、三代混合组装软件OPERA-MS
文章目录 宏基因组二、三代测序混合组装软件OPERA-MS热心肠日报摘要主要结果图1. OPERA-MS工作流程图图2. 宏基因组数据混合组装基因组评测图3. 组装虚拟肠道微生物组图4. 移动元件和与人肠道微生物组中宿主物种的关联 总结Reference相关阅读猜你喜欢写在后面 宏基因组二、三代…
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2024/12/3 0:27:44
多模态系列论文--BEiT-3 详细解析
论文地址:Image as a Foreign Language: BEIT Pretraining for All Vision and Vision-Language Tasks 论文代码:BEiT-3 BEiT-3 1 引言:Big Convergence(大一统)2 BEIT-3预训练框架3 下游任务实现框架4 实验效果5 总结…
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2024/11/2 2:32:46
具备捕获 Web2 用户能力的 PoseiSwap,治理通证$POSE再度涨超 360%
Nautilus Chain 是行业内首个模块化 Layer3 架构链,开发者能够基于模块化进行定制化开发,并有望进一步推动 Web3 应用向隐私、合规等方向发展。当然,Nautilus Chain 的特殊之处还在于为生态用户带来丰厚的空投预期,据悉上线 Nauti…
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2024/11/29 10:30:01