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宏基因组公众号4年精华文章目录，收藏贴(2021.1更新)
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强宏基因组学技术和成果交流传播，推动全球华人微生物组领域发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。 …
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2024/10/24 11:07:26
MEGAHIT：多快好省的宏基因组装工具
文章目录 MEGAHIT：通过简洁的de Bruijn图为超大型复杂宏基因组拼接的超快速单节点解决方案热心肠日报摘要主要结果图1. MEGAHIT工作流程表1. MEGAHIT和SPAdes在大肠杆菌数据集上的表现表2. MEGAHIT与Howe et al.和Minia组装结果比较表3. MEGAHIT与Howe et al.和Mini…
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2024/12/2 22:40:42
MS：陈宏+孙嘉+谢黎炜-肠道菌群是低碳饮食减重的决定因素
https://doi.org/10.1128/Spectrum.00223-21 在全球范围内，超重/肥胖患病率呈快速增长趋势，肥胖及其并发症不仅严重影响患者生活质量，也给社会和家庭带来沉重的经济负担。低碳水化合物饮食（low carbohydrate diets，LCD…
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2024/10/26 4:23:46
来来来，一起来pick宏基因组binning分析工具
发表期刊：Computational and Structural Biotechnology Journal（IF7.271）
发表时间：2021
研究背景
微生物是生物和环境的营养循环和代谢过程所必需的，并且与生理学至关重要。虽然微生物可以使用传统培养的方法来确定…
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2024/10/27 10:09:01
宏基因组分析软件专题（一）| 热心肠日报
今天是第1227期日报。 Nature Biotechnology综述带你开展宏基因组实验和分析，在众多分析软件中选择不再困难。还有三代测序和宏表观组等前沿技术。 基于鸟枪法宏基因组测序经历了十余年的快速发展，在分析的每个环节上出现了众多软件，让读者选…
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2024/11/29 10:30:05
MS | 江南大学徐岩等发现中国白酒产区地域微生态酿造优势的新证据
地理相关的真菌-细菌互作贡献了高复杂度自发发酵过程中地理依赖性风味的形成 Geographically Associated Fungus-Bacterium Interactions Contribute to the Formation of Geography-Dependent Flavor during High-Complexity Spontaneous Fermentation Research Article&#…
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2024/11/5 13:35:36
SemiBin宏基因组半监督分箱工具中GTDB数据的下载与配置
最近想学一学宏基因组的分箱工具使用（讲真的，感觉bin还是挺复杂的，不是我这种小白该去涉猎的），本来想看看老牌工具metaWRAP的使用细节，奈何微信推送了一条新的分箱工具——SemiBin，还是基于当下…
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2024/11/29 10:30:01
宏基因组注释和可视化神器MEGAN入门
文章目录 MEGAN-宏基因组功能和物种分类MEGAN功能简介原理简要示意图MEGAN特有文件格式：RMAMEGAN下载 MEGAN使用MEGAN（linux版本安装）MEGAN使用指南（Linux）提取注释内容（物种和功能）：…
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2024/10/26 12:16:40
