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关于bwt算法的原理可以看看这个博客,讲得很好 https://blog.csdn.net/blackjack_/article/details/73801003 本文是利用python写的bwt算法的编码和解码,有兴趣的同学可以看看。例子是banana这个字符串 def bwtencode(): global L, F L F text "…
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2024/11/20 14:49:53
用计算机刻盘,用电脑可以刻录光盘吗?
您好 常用的镜像文件类型: 1、ISO 这种格式的镜像扩展名为.ISO,是以ISO-9660格式保存的光盘镜像文件,是最常见的光盘镜像格式,大家对ISO9000质量体系认证有印象吗?一个含义,标准出自一家----ISO,…
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2024/11/2 22:05:49
bwt转成html,[IR] BWT+MTF+AC
BWT Idea:ide 压缩技术主要的工做方式就是找到重复的模式,进行紧密的编码。post BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个类似的文本,转换后使得相同的字符位置连续或者相邻;编码 以后可使用其余技术如:Move-to-fr…
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2024/10/17 5:39:08
BWT前缀树的编码与解码
BWT简介 BWT算法可以将原文本转换成相似文本,并且可以用其他技术进行压缩。 编码方式
(1) 将文本串后加一个文本中不会出现的字符‘#’。(定义#小于文本串中任一字符) (2) 将文本串不断右移&am…
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2024/10/19 17:27:57
bwt比对算法 C语言,BWT比对算法
简介 BWT算法在多款序列比对软件(BWA,bowtie)中都有涉及,那么对于RNA-seq的2代数据,一般建库长度是单端300bp,双端各150bp左右。 序列比对 对于两个序列进行比对,即pairwise alignment,我们可以按比对方式分…
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2024/11/15 3:37:31
bwt比对算法 C语言,BWT数据压缩算法
urrower-Wheeler变换 1994年 Michael Burrows 和 David Wheeler在《A Block-sorting Lossless Data Compression Algorithm》一文中共同提出了一种全新的通用数据压缩算法,Burrows-Wheeler Transformation。 burrows和wheeler设计的bwt算法与以往所有通用压缩算法的…
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2024/10/24 17:59:34
bwt比对算法 C语言,DNA比对算法:BWT
DNA比对算法:BWT BWT算法,实质上是前缀树的一种实现。那么什么是前缀树呢? 一、前缀树 对于问题p in S?如果Srpq,那么p为S前缀rp的一个后缀。 于是,为了判断p in S 是否成立,我们找到S的所有前缀…
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2024/10/23 9:50:51
C/C++内存管理(内存分布、动态内存分配、动态内存分配与释放、内存泄漏等)
喵~ 内存之5大区(栈区、堆区、静态区、常量区、代码区)C/C中各自的内存分配操作符内存泄露?内存泄漏检测方法 内存之5大区(栈区、堆区、静态区、常量区、代码区) 1、栈区(stack):由编译器自动分…
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2024/11/13 14:39:36