BWT Idea:ide 压缩技术主要的工做方式就是找到重复的模式，进行紧密的编码。post BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个类似的文本，转换后使得相同的字符位置连续或者相邻；编码 以后可使用其余技术如：Move-to-fr…

BWT简介 BWT算法可以将原文本转换成相似文本，并且可以用其他技术进行压缩。 编码方式 （1） 将文本串后加一个文本中不会出现的字符‘#’。（定义#小于文本串中任一字符） （2） 将文本串不断右移&am…

简介 BWT算法在多款序列比对软件(BWA，bowtie)中都有涉及，那么对于RNA-seq的2代数据，一般建库长度是单端300bp，双端各150bp左右。 序列比对 对于两个序列进行比对，即pairwise alignment，我们可以按比对方式分…

urrower-Wheeler变换 1994年 Michael Burrows 和 David Wheeler在《A Block-sorting Lossless Data Compression Algorithm》一文中共同提出了一种全新的通用数据压缩算法，Burrows-Wheeler Transformation。 burrows和wheeler设计的bwt算法与以往所有通用压缩算法的…

DNA比对算法：BWT BWT算法，实质上是前缀树的一种实现。那么什么是前缀树呢？ 一、前缀树 对于问题p in S？如果Srpq，那么p为S前缀rp的一个后缀。 于是，为了判断p in S 是否成立，我们找到S的所有前缀…

喵~ 内存之5大区（栈区、堆区、静态区、常量区、代码区）C/C中各自的内存分配操作符内存泄露?内存泄漏检测方法 内存之5大区（栈区、堆区、静态区、常量区、代码区） 1、栈区（stack）：由编译器自动分…

先看Demo 文本查询，下拉复选框查询，无参数时查全部 有参数传参时 1.定义数据连接 测试地址： http://fine-doc.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/book.json 2.新建json数据集，查询全表 2.1.查询全表 2.2.查询单个字段 3. 上述是简单…

目录 json的方法timecollectionsdatetimetimestampsocket json的方法 json.load：表示读取文件，返回python对象 json.dump：表示写入文件，文件为json字符串格式，无返回 json.dumps：将python中的字典类型转换…