课程地址：山东大学生物信息学 文章目录 一、生物数据库1.1 PubMed 文献数据库1.2 一级核酸数据库1.2.1 INSDC Genbank ENA DDBJ1.2.2 基因组数据库 Ensemble1.2.3 微生物宏基因组数据库 1.3 二级核酸数据库1.4 一级蛋白质序列数据库 UniProt1.5 一级蛋白质结构数…

1.介绍： vcf2omim数据量为：rdd2.count:8623 dataProcessing数据为： rdd2.count:10884 sum:2300 8584 2300为AlternateAllele有逗号的数量，例如ref为A，AlternateAllele为G,C 2.原因分析，主要是读入vc…

学习了一下栅格地图在matlib中的表示方法，其实和很多都是差不多的。 参考 清除命令 % clc：清除命令窗口的内容，对工作环境中的全部变量无任何影响 % close all:关闭所有的Figure窗口 % clear all：清除工作空间的所有变量&#xff…

1.数据： // var vcfFile "file/callDisease/input/small.vcf" // var dbSnp2omimFile "file/callDisease/input/omimFilter9Text.txt" // var omimFile "file/callDisease/input/genemap.txt"修改过small数据&#xff1…

OMIM数据库：大神私藏的数据库，99.9%的人都不知道！ 2019-03-04 11:00乳腺癌/医生/肺癌 “ GEO、NCDB、TCGA、SEER数据库这些我都知道，但OMIM是什么鬼？ OMIM（Online Mendelian Inheritance in Man&#xff0…

腾讯omi项目中的omim，基于typescript，pr了omim-tag组件，已被commit。 omim线上体验地址：omim github地址： mac-tag 个人blog地址： blog demo： import ../../src/tag/index.tsx import { render,…

1.下载： 首先收到【2】，来源是【2】 【1】中有描述： You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim…

1.代码： /** * author xubo * more code:https://github.com/xubo245/SparkLearning * more blog:http://blog.csdn.net/xubo245 */ package org.gcdss.cli.disease import java.text.SimpleDateFormat import java.util.Date import org.apache.spark.{Sp…