博文复制了原博客，做了少许修改 将原始序列经过BWT转换后， 可以更方便的进行压缩；而且BWT转换是一个可逆的转换，能够根据转换后的序列还原出原始序列； BWT转换首先将序列进行在序列的末尾插入一个字符，并…

Berkeley小波变换（BWT）由四个方向上的四对母小波组成。在每对中，一个小波具有奇数对称性，另一个具有偶数对称性。通过对整个集合（加上一个常数项）的平移和缩放，小波在二维中形成一个完整的正交基…

MATLAB读取BWT901BLECL5.0 这个太简单了，使用BWT901CL的MATLAB程序改了一下参数。 代码 clear all; close all; clc; instrreset; disp(Press CtrlC to stop collecting data!) sserial(com4,baudrate,115200); fopen(s) ;%Open Com Port 请将COM19换成电脑识别…

ubuntu下使用维特智能蓝牙5.0 1、这里我们用的是VMwaer虚拟机，共用本地物理机的串口,18.04版本系统自带CH340驱动插上直接用即可（更低版本安装ch340请参考该博客） 2、这里我们打开ubuntu自带的串口助手，如果没有自带串口助手需要…

测序数据alignment有一些不错的算法，其中Burrows–Wheeler transform算法（简称BWT）是非常高效的一种。本文简单总结下BWT算法思路和原理。 BWT的计算与还原 BWT计算及还原步骤此处不赘述，大致如下图（图1和图2&#x…

C#:实现BurrowsWheelerTransform（BWT）压缩算法 using Algorithms.DataCompression; using NUnit.Framework; using NUnit.Framework.Internal;namespace Algorithms.Tests.Compressors {pu

Burrows-Wheeler变换及其应用 引言 在数学中，经常需要对研究的对象做一些变换，使得问题的处理变得更简单，例如最常见的Fourier变换可以将信号从时域信号变换为频域信号。Burrows-Wheeler变换（后面简称BWT）也是一种变…

本文介绍了BWT算法。 bwa是目前最流行的二代测序比对工具，其中就用到了BWT算法。BWT（Burrows-Wheeler Transform）算法是一种数据转换算法，它将一个字符串中的相似字符放在相邻的位置，以便于后续的压缩。 简要回顾 BW…