研究中常见两组的进行比较。即是一种事物相比另一种，有什么样的变化。如果这个变量是类别型，则可以直接使用相关性分析的方法，那么现在所分析的变量是连续型的组间比较，并假设为正态分布。 数据使用为MASS包的UScrime数据集&#…

功能蛋白质组学是对蛋白质在功能活性水平（例如表达和修饰）的大规模研究。对诸如癌症等复杂疾病的研究表明，遗传改变并不能说明该疾病的所有原因。蛋白质水平和结构的变化也已显示在肿瘤发展和进展中起关键作用，而遗传变化并未反映…

1.INTRODUCTION（介绍） 1.数据来源 GDC Legacy ArchiveGDC Harmonized database 2.barcode 2.Install.packages(包安装) 3.数据下载 我们以胆管癌数据为例进行展示 下载表达数据 #数据查询（就像你在页面网站上点来点去） query…

❝ 已经付费加群的小伙伴无需二次付费，等待师兄后续更新即可！ ❞ 封面 从这个系列开始，师兄就带着大家从各大顶级期刊中的Figuer入手，从仿照别人的作图风格到最后实现自己游刃有余的套用在自己的分析数据上！这一系列绝…

本文仅为笔者学习过程中的总结笔记，如有错误敬请指正。 什么是显著性检验 显著性检验（significance test）是用于检测科学实验中实验组与对照组之间是否有差异以及差异是否显著的办法。 要先对科研数据做一个假设，然后用检验来检…

卡方检验，是一种广泛应用于统计学和科研领域的非参数检验方法。它主要用于分析分类变量之间的关系，以评估观察频数与期望频数之间的差异是否具有统计学意义。卡方检验的基本原理是通过比较实际观察到的频数与基于某种假设（如变量间独立&#…

TCGAbiolinks (三&#xff09;获取全面的临床数据 – 璃墨的小站 library(TCGAbiolinks) 一、基础数据下载 1 下载GDC文件 query <-GDCquery(project "TCGA-PRAD", data.category "Clinical", file.type "xml") 2 组合数据 #选择要…

TCGA临床数据的整理是一个基本的操作 我们选择临床数据在Data category 中选择clinical 最重要的在Data format 中一定要选择XML的]格式 选择自己研究的TCGA肿瘤类型&#xff0c;添加到cart里面下载数据 点击download 下载 cart的内容 保存你们自己喜欢的位置。下面一步是个…